AEでアンカーポイントの表示とか無くなっちゃたら？
After Effects でアンカーポイント（レイヤーコントロール）が見えなくなるのは、誤って「レイヤーコントロールを非表示」にしてしまっているケースがほとんどです。以下のいずれかで元に戻してみてください。
ショートカットキーで切り替え
Mac:
⌘＋⇧＋HWindows:
Ctrl＋Shift＋H
これで「レイヤーコントロールの表示／非表示」がトグル切り替えされます。
メニュー ＞ 表示（View） ＞ レイヤーコントロールを表示（Show Layer Controls）
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